黄历2017年。超级大国神圣布里塔尼亚帝国占领了日本，将日本改名为「11区」，称呼日本人为Eleven。日本人们被剥夺了名字和自由，就这样生活了7年。布里塔尼亚帝国的皇子鲁路修作为人质被送到了日本，战后，他隐藏了自己的身份作为一名学生在日本生活。 鲁路修偶然被卷入反抗军和布里塔尼亚军队的战斗，之后和迷之少女C.C相遇，并得到了“GEASS”绝对服从的力量。得到GEASS的鲁路修明白了，将那个舍弃了自己和妹妹娜娜莉的布里塔尼亚帝国击溃的时刻终于来了。 鲁路修作为假面反叛者“Zero”率领反抗布里塔尼亚的反抗军·黑色骑士团，开始了秘密活动。另一方面，青梅竹马的枢木朱雀虽然是Eleven，同时他也是名誉布里塔尼亚人，并成为了布里塔尼亚军队的战士。被选拔成为新型兵器兰斯洛特的驾驶员的朱雀成为了布里塔尼亚军队的要员。 鲁路修=“Zero”和朱雀，在不知道对方立场的情况下再会了。反叛的思想，阻碍友情的二难推理。现在，命运的齿轮开始转动了。
