在加州海滩出生的小海龟萨米,跟其他海龟仔一样,须要深入海洋,踏上成长旅程,期间他遇上了刚刚孵化的美女海龟莎莉,一见钟情。谁料,一次突发事件,两只小海龟无端失散。萨米一方面要坚负海龟仔的成长使命,穿越海洋之旅,重回出生之地,同时它必须寻回他的至爱莎莉。萨米不畏艰辛,在老友雷的陪同下,克服重重难关,经历紧张刺激的冒险旅程。期间,萨米发现人类竟然不停破坏地球的自然环境。森美感到失望之际,却在危难间得到人类的拯救。时间一天一天过去,萨米必须击退食人鱼、力敌疯狂非洲海雕,寻找传说中的水底秘密通道。终于,萨米找到了莎莉,而莎莉亦没有忘记萨米。