PIKAIA第二季动画全集讲述近未来，因为为让无法居住生命的地球再生的“寒武纪计画”获得成功，为去往下一个阶层而发展的“异次元调查计画”开始了。文森和汉娜，以及新加入的一员温蒂与试验品皮卡虫一起前往古生代调查，为获得令地球再生的开键lost code的三人驾驶着全新的Biomimetics Suit（BMS）前往泥盆纪的海洋的异次元潜行再次启动！