江户时代前期的武士神崎千水和忍者真田兼六穿越到了自己时代数百年后的2030年。2030年的世界一个名叫“Gibia“的病毒正在大流行，受到感染变成怪物的人类和违法者的存在使世界走向荒废。在病毒研究者的助手船田凯瑟琳的帮助下，千水和兼六和她一起展开了杀机重重、生死攸关的冒险之旅。