魔法。自从成为真正的技术以来还不到一个世纪， 今春，持有施展魔法能力的「魔法师」培育机构「魔法科高中」，某位少女将入学就读。 容貌秀丽、完美无缺的优等生——少女的名字为司波深雪。 梦想着和一同入学的兄长——达也过着亲密的高中生活， 但挡在她面前的是一科生与二科生—— 优等生与劣等生的高墙……!?