魔法少女小圆剧场版：叛逆的物语故事围绕着五位魔法少女的成长与冒险展开，在有着极端偏好的编剧虚渊玄的妙思之下，层层环绕的因果关系把剧情逐渐推向令人意想不到的结局，更有热衷粉丝细致入微的从画面中去挖掘哲学、宗教含义。