神圣十月主要是述说三位女孩子和一位侦探在Alkana市的黑木侦探社工作的故事。城市里连续发生着不可思议的奇怪事件，还有为解决事件聚集起来的拥有特殊力量的少女侦探们聚集到一起：修道院里的十四岁孤儿叶山小十乃、身为影视偶像的白藤菜月以及前世的噩梦所缠绕的迷样少女圣三咲。想要审判污秽现有世界的人，想要保护现有世界的人，谁代表正义？谁又代表邪恶？小十乃与失忆少年相遇的那刻，命运的齿轮已经开始转动，新生？毁灭？还是不可知的未来？ 三位少女所面对的将是决定人类存亡的命运……