故事发生在未来，当时人们的科技已经非常发达，可以再宇宙中自由航行，女高中生加藤茉莉香，本来过着非常普通的生活，一边打着短工，一边在快艇部参加学习活动。但是一天平静的生活被两位自称是她已去世父亲的部下，邀请她担任海贼船的船长。于是全新的宇宙之旅开始了。