终物语第二季动画全集改编自西尾维新原作小说。故事的时间点在十月下旬，神原骏河向身为高三生的阿良良木历介绍了一位转校生忍野扇。随后扇为讨论一些事而与阿良良木见面，并拿出她所绘制的直江津高中平面图，告知阿良良木某些她觉得不可思议的地方。以此为开端，一连串贯穿所有事件的故事就此揭幕。